Разделение эволюционного древа на два ствола — одноклеточных и многоклеточных — произошло, по его мнению, одновременно с возникновением клеточной организации. При этом одноклеточные существа — это прежде всего организмы и поэтому не могут быть сравнимы с отдельными клетками тканей многоклеточных. Выдвинув предположение о независимом развитии одноклеточных и многоклеточных, Заварзин задался вопросом: не могли ли у одноклеточных возникнуть дифференцировки, аналогичные пограничной ткани и ткани внутренней среды? Поскольку эволюция простейших и многоклеточных совершалась параллельно, подобная возможность им не исключалась. Мы вправе ожидать,- писал он,- и в организме простейших подобной же дифференцировки на пограничные и внутренние части и их сходной эволюции, конечно, своеобразно преломленной в одноклеточной организации. Ошибкой было бы думать, что Заварзин придерживался мнения, будто в процессе эволюции одноклеточных сформировались подлинно тканевые структуры. Говорить о тканях одноклеточных нельзя,- утверждал он, предпочитая в данном случае говорить о структурах, аналогичных тканям многоклеточных. Настоящими тканями не располагают, по мнению Заварзина, ни губки, ни даже наиболее примитивные кишечнополостные. Поэтому и относительно простейших речь может идти лишь о дифференцировках, сравнимых с тканевыми дифференцировками. Например, у инфузорий мерцательный покров сравним, по Заварзину, с мерцательным эпителием, псевдохитин (защитная оболочка)- с кожным эпителием, эктоплазматический слой тела амебы — с кожной поверхностью, обладающей способностью к фагоцитозу, и в эволюционной перспективе способной приобрести более сложную функцию и структуру — локомоторную или защитную.