В тех случаях, когда выделяются атипичные культуры, вызывающие сомнение в смысле их принадлежности к микобактериям туберкулеза или к кислотоупорным, для их дифференцировки используется комплекс специальных исследований. Глубинные методы посева на жидкие питательные среды (синтетические, полусинтетические и кровяные) На жидких средах выявляются микрокультуры микобактерий туберкулеза, что в ряде случаев ускоряет получение положительных результатов. Микроколонии типичных микобактерий туберкулеза имеют вид жгутов или кос. Последнее обусловливается наличием так называемого корд-фактора. По химической структуре это тригалоза-6,6-димиколат. Щелочной гидролизат корд-фактора содержит две молекулы тригалозы. Bloch (1953), Noel (1955), выделившие эту фракцию, назвали ее корд-фактором, так как она выделяется из культур, растущих в виде жгутов, и способствует склеиванию микобактерий туберкулеза. Под влиянием туберкулостатических препаратов количественное содержание корд-фактора уменьшается (из 2 г типичных микобактерий можно получить 1-2 мг корд-фактора) и в жидких средах такие микобактерий кос не образуют, растут в виде отдельных кучек или дают разбросанный рост. Такой же рост характерен для атипичных микобактерий, штаммов птичьего типа и сапрофитов. Культуры, выросшие на жидких средах, не могут быть использованы для их дальнейшего изучения — лекарственной чувствительности, каталазной активности, вирулентности и т. д., и это является недостатком метода микрокультивирования. Если все же требуется изучение культур, выросших на жидких средах, то делают пересевы с жидких сред на плотные, что значительно удлиняет срок исследования. Посевы на жидкие среды рекомендуется использовать для определения наличия корд-фактора.