На основании подобных различий Беклемишев выделил три категории онтогенезов: первая из них характеризуется сохранением на всем протяжении онтогенеза не вполне поляризованной структуры; ко второй относится онтогенез, часть которого располагает поляризованной, а часть — неполяризованной структурой; к третьей относятся онтогенезы, располагающие на всем своем протяжении поляризованной структурой. Онтогенезы первой и третьей категории Беклемишев отнес к однородным онтогенезам, онтогенез второй категории — к неоднородным. Ясно, — писал он, — что онтогенезы второй категории ни в коем случае не являются первичными. Какая категория онтогенезов из двух оставшихся — первая или третья — является более примитивной из данных самой эмбриологии заключить нельзя, так как по ходу процесса они одинаково примитивны — однообразны. И все же Беклемишев назвал критерий, с помощью которого можно, по его мнению, приблизиться к разрешению этой задачи: критерием является не ход процесса, а его содержание. Онтогенез, в котором каждая стадия сравнительно-анатомически, конструктивно примитивнее, чем гомологичная стадия другого онтогенеза, является сам примитивнее. Анатомия выступает здесь критерием примитивности в сравнительно-эмбриологических исследованиях. Итак, Беклемишев поставил эволюцию тканей в прямую связь с эволюцией онтогенеза. Гистология становилась необходимым и инструментом для суждения о конструкции стадий онтогенеза, для познания эволюции онтогенеза. Данные гистологии включались в метод филогенетики: метод тройного параллелизма обогащался новым полноправным элементом. Необходимость такого подхода к эволюционной проблематике в гистологии назрела давно. Классификации тканей, создаваемые на эмбриологической основе, встречали возражения. Биогенетический закон, который лежал в основе классификации тканей братьев Гертвигов, предопределил критику в ее адрес со стороны Беклемишева.