Заварзин стремился найти эволюционное объяснение направленности тканевой эволюции путем анализа условий, в которых последняя совершается. Для этого он выделял ткань из организма, рассматривая ее как некоторую относительную, уравновешенную в известных пределах в себе систему, имеющую свои элементарные биологические константы и развивающуюся и вместе с организмом, и в себе самой. Факторы, которые учитываются в теории Дарвина — половой процесс, изменчивость, наследственность, взаимодействие со средой, борьба за существование и естественный отбор, влияют на ткани опосредованно, через эволюцию целостного организма, и непосредственного влияния на развитие тканей, очевидно, оказывать не могут. Перенесение в гистологию понятия борьбы за существование Заварзин считал методологически неправильным и связывал неудачи, которые терпели такие попытки, с механическим распространением закономерностей высшего порядка на более элементарные процессы, протекающие качественно иначе. Следовательно, по Заварзину, задача эволюционной гистологии состоит в том, чтобы, опираясь на общую теорию эволюции, созданную Дарвином, вскрыть специфические закономерности тканевой эволюции, в которых общие закономерности эволюции присутствуют в снятом виде. За отправное положение Заварзин принял априорный тезис, согласно которому живое вещество в своих самых элементарных свойствах, включая физико-химические и молекулярные, качественно отличается от мертвого вещества, мертвого белка. Далее Заварзин выдвинул идею относительного постоянства функции и биологической константы внутренней среды у всех животных. По его мнению, условия, которые создает внутренняя среда, с момента возникновения жизни изменяются значительно медленнее, чем совершается эволюция живого вещества.