Прежде всего было установлено, что не всякая болезнь и не всякий патологический процесс вызываются микробами и что наличия последних в организме еще недостаточно для того, чтобы возникло то или иное заболевание (бациллоносительство, скрытая или дремлющая инфекция). Далее выяснилось, что при прочих равных условиях два организма по-разному реагируют на инфекцию и по-разному ведут себя при одном и том же заболевании. Внимание медицины, таким образом, сосредоточилось на изучении причин, изменяющих устойчивость организма по отношению к возбудителям болезней. И. И. Мечников (1845-1916) внедрил в медицину сравнительно-патологический метод исследования, который позволил вскрыть сущность самой реакции организма на воздействие болезнетворных агентов. Его исследования послужили началом плодотворного и углубленного изучения вопросов патологии, особенно инфекции и иммунитета. Учение об аллергии, т. е. измененной чувствительности организма, созданное Шарлем Рише (1902), Г. П. Сахаровым, впервые описавшим анафилаксию у морской свинки (1905), и Пирке (1905), показало, какое огромное значение имеет изучение измененной чувствительности для понимания происхождения всего заболевания. Учение об аллергии дает теоретическое обоснование индивидуальных биологических особенностей людей и способствует выработке индивидуального подхода к заболевшему человеку. Учитывая аллергические реакции, врач может глубже и вернее понять, почему одно и то же заболевание протекает у разных людей неодинаково. Многочисленные экспериментальные и клинические работы последних четырех десятилетий не оставляют сомнений в том, что очень большое количество симптомов, которые наблюдаются у постели больных с острыми инфекциями, представляют не что иное, как аллергическую реакцию тканей и органов больного в ответ на воздействие микробов, на продукты их жизнедеятельности и на продукты собственного обмена и распада тканей. Эти факты не согласовывались и не укладывались в рамки этиологии бактериологической эры. Становилось ясно, что наличия микробов в организме еще недостаточно для развития патологического процесса, что для этого необходим ряд других условий.