Оставался также открытым вопрос: действительно ли в основе сходства тканей многоклеточных животных лежит филогенетическое родство или же это сходство обусловливается не подлинным, хотя и очень древним родством, которому в эволюции тканей Хлопин не придавал решающего значения, а какими-то пока неизвестными законами организации живого? Нельзя полностью откинуть и другое предположение. Сохраняя внешнее сходство, ткани могут отличаться по важным деталям своей внутренней, субклеточной организации — деталям, которые гистология еще не научилась улавливать. Хлопин понимал это и счел нужным отметить, что гистологическое сходство отнюдь не является тождеством и что дивергентные черты в организации животных, принадлежащих к разным типам, не могут не быть связаны с гистологическими различиями одноименных тканей, которые в одних случаях сразу бросаются в глаза, в других — представляются с первого взгляда менее очевидными и поэтому в значительной степени игнорируются. Существование дивергенции тканей в процессе эволюции не вызывало у Хлопина сомнений. Эта закономерность тканевой эволюции проявляется, по его данным, во многих случаях. Так, эктодермальный кожный эпителий может иметь строение: однослойное мерцательное (турбеллярии, немертины), кутикуляризованное (кольчатые черви); гиподермы членистоногих, снабженной хитиновым панцирем и образующей внутренние, скелетные части; погруженного эпителия сосальщиков и лентецов; модификации многослойного эпителия у позвоночных. Вследствие дивергентной дифференцировки родственные ткани могут приобретать, таким образом, все более глубокие отличия. К аналогичному эффекту ведет специализация, способная затушевать или даже снять первоначальное сходство гистологических структур. Этим объясняется своеобразный характер выстилки участвующей в дыхании легочной ткани высших позвоночных.